学籍档案丢失可以按照下面流程来办理：
1、学籍档案丢失首先要开具一个档案遗失证明，一定是要加盖公章（可以找您现在的单位）；
2、然后拿着您开好的遗失证明，自己写一个档案的补办申请，到学校去盖章并签字；
3、最后按照学籍档案内的所需材料一一进行补办，通常只要补办这些主要的材料就可以了如：毕业生登记表，成绩单，政治面貌信息，体检表，奖惩材料和转正申请书；
4、补好以上材料后就可以交给学校审核，审核好了学校这边会在档案袋外加盖公章，然后交给就业指导中心登记录入，最后再密封。法律依据：《中华人民共和国义务教育法》 第二十九条 学校及其他教育机构行使下列权利：
（一）按照章程自主管理；
（二）组织实施教育教学活动；
（三）招收学生或者其他受教育者；
（四）对受教育者进行学籍管理，实施奖励或者处分；
（五）对受教育者颁发相应的学业证书；
（六）聘任教师及其他职工，实施奖励或者处分；
（七）管理、使用本单位的设施和经费；
（八）拒绝任何组织和个人对教育教学活动的非法干涉；
（九）法律、法规规定的其他权利。
国家保护学校及其他教育机构的合法权益不受侵犯。
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